Trama

Il piano segreto della Seele prende corpo, e il quartiere generale Nerv finisce sotto attacco. Mentre i dipendenti Nerv cercano inutilmente di difendersi e divengono vittime di un vero e proprio massacro, Gendo prende con sé Rei e decide di avviare l'unione fra Adam e Lilith, ma viene fermato prima da Ritsuko (che paga con la vita il suo tentativo) e poi da Rei stessa. Nel frattempo Misato salva Shinji dall'attacco dei militari, e spedisce Asuka a battersi contro la Serie Eva lanciata dalla Seele, sia Misato che Asuka non sopravviveranno alle rispettive missioni. Shinji, sconvolto dalla fine di Misato e Asuka, nonché dall'apparizione della gigantesca Lilith, che racchiude in sé l'essenza di sua madre e di Rei Ayanami, lascia che l'Unità Evangelion 01 divenga lo strumento designato dalla Seele per avviare il Third Impact e portare a compimento il Progetto per il Perfezionamento dell'Uomo. Tutti gli AT Field del pianeta cedono, e ogni essere vivente torna allo stadio primordiale di LCL. Lo spirito di Shinji si confronta con quelli di Rei, Kaworu e Yui, lasciando uno spiraglio di speranza all'eventualità che gli esseri viventi possano ricreare le proprie identità singole.

Uscito in Italia in DVD nel 2005 con Panini Video, arriva al cinema il 28 giugno 2021 con NexoDigital insieme a Evangelion: Death (True)2 in un unico evento.